Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms