Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc2bQ7TPM1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms