Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms