Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ParpbpQ6IRT3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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