Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg9aQ68FE2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atg9aQ68FE2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atg9aQ68FE2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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