Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msi1Q61474 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms