Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms