Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vmn1r196Q5SVD5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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