Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm648Q3UJ22 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm648Q3UJ22 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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