Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttll12Q3UDE2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll12Q3UDE2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms