Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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