Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms