Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd11Q1RNF8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms