Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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