Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms