Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms