Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms