Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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