Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms