Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hoxd13P70217 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms