Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp25P57080 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp25P57080 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp25P57080 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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