Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NcanP55066 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NcanP55066 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NcanP55066 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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