Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc6a9P28571 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc6a9P28571 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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