Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpraP18052 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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