Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms