Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1bP0C7A0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms