Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01783 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01783 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01783 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms