Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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