Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih2O35089 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih2O35089 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cnih2O35089 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms