Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm17535J3KMR8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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