Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms