Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm26992S4R1A3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms