Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms