Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms