Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms