Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms