Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MNCb-2875Q9DCB3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms