Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms