Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcg8Q9DBM0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcg8Q9DBM0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms