Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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