Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms