Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms