Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Shisa9Q9CZN4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms