Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms