Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a6dQ99N07 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms