Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms