Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms