Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms