Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkn3Q8K045 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1387.9 ms