Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp27Q8CEG8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp27Q8CEG8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp27Q8CEG8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp27Q8CEG8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms